Сотрудник был в отпуске без сохранения заработной платы с 22 по 23 августа. Сделан документ Отпуска организации, проведен. При этом в Документе Табель учета рабочего времени в эти дни ставиться явка. В чем может быть дело?

Вариантов может быть несколько
1. Помимо кадровых документов, есть расчетные. Для отпуска есть расчетный документ тоже
2. Косяк в плане видов расчета, если он самодельный, стоит не тот классификатор времени
Посмотри

Да, все заработало, большое спасибо. Обработкой анализ неявок создала документ Невыходы в организациях, который засторнировал дни в которые сотрудник не работал.