В организациях, осуществляющих розничную торговлю  по кредиту счета 90 "Продажи" отражается продажная стоимость проданных товаров , а по дебету - их учетная стоимость (в корреспонденции со счетом 41 "Товары") с одновременным сторнированием сумм скидок (накидок), относящихся к проданным товарам (в корреспонденции со счетом 42 "Торговая наценка").

Подскажите пожалуйста как понять "с одновременным сторнированием сумм скидок" ?

Дт 62 Кт 90 Цена без скидки ( к примеру 1000)
Дт 62 Кт 90 Сумма скидки (сторно, к примеру 100)

ИТОГО:
Дт 62 Кт 90 на сумму 900

Спасибо за ответ, толька уточнить то есть сумма 100 руб, во второй проводке она идет с минусом да? то есть 1000 + (-100) = 900 так олгаритм работает в бухучете?

Да с минусом.