Как можно ускорить работу со сводной таблицей чтобы при изменении состава измерений данные бы уже брались не из итогов регистров, а из ранее полученных данных? выгружать предварительно в таблицу значений или есть более простой способ?

но тогда
придется хранить( кэшировать )данные с макс. кол-вом измерений либо с наиблее часто исползунмыми + пресчет если не угадали.

посмотрите в сторону агрегатов 1с.

если речь действительно о таблицах итогов, то это и так агрегаты с точки зрения проектирования БД.