Подскажите, пожалуйста, если обновляешь конфигурацию, формы отчетности автоматически ообновляются?

только те, которые встроены в конфигурацию.
а есть еще варианты встроенных , которые хранятся в бд.

причем в настройках каждого отчета есть флажок, указывающий какойверсией пользоваться.

изменяется ли он при обновлении - не помню