Подскажите, есть ли возможность как-то указывать именно дополнительные начисления на закладке Начисления документа, и почему нет возможности делать это в явном виде, может есть какие-то причины.
навскидку делаешь новую колонку в документе "перемещения", с ссылкой на "Доп. начисления". Заполняете, остаётся прописать проводки. Только действительно зачем? Доп. начисление в програмене постоянным быть не может... В полне можно обойтись "основными".