Есть таблица значений, которую заполняю программно.

Как в момент добавления строки выделить ее другим шрифтом и цветом?

Другими словами выделение идет не по какому-то условию типа Сумма<0 , а по логике известной только на момент формирования таблицы значений.

НовСтр = Объект.ТЗ.Добавить();
Выделять = какой-то код который говорит выделять ее или нет.
Если Выделять Тогда
  // тогда что ?
КонецЕсли

юзай условное оформление

Добавь колонку в ТЗ, пересчитывай по своему принципу в момент заполнения и как говорили выше - юзай условное оформление )