Подскажите, из-за чего может возникнуть ситуация в ЗУПе : в документе "Зарплата к выплате" сумма к выплате (характер выплаты  = зарплата) может рассчитываться так, что после проведения выплаты остается еще задолженность за предприятием на конец месяца. Задолженность в разрезе месяцев начисления не учитывается.

Эх, жалко нет deBug

(0) Ну, так посмотри что у тебя на остатках РН "ЗарплатаЗаМесяцОрганизаций". Заполнение выполняется по нему.

(2) после проведения выплаты по этому регистру в остатке получается 0
а в регистре "ВзаиморасчетыСРаботникамиОрганизаций" после всех выплат получается остаток 560 рублей
Тестирование и исправление с пересчетом итогов, а также перепроведение документов делал - на данную ситуацию это не повлияло

(3)[Тестирование и исправление с пересчетом итогов, а также перепроведение документов делал - на данную ситуацию это не повлияло]
да, ЗиУП-у и то и другое пофиг

а долг 560 рублей тянется с прошлых расчетных периодов

Похоже что ндфлкзачету, переудержали у когото

(6)+1 Проверяй НДФЛКЗачету

имущественные вычеты обычно так косячат...