Подскажите, в отчете Расчет по авансовым платежам на имущество неправильно выводит остаточную стоимость ОС, в счет может быть причина?

С чем сравниваете?

(1) Ведомость амортизации ОС.
Откуда берутся эти данные???

(2) В регламентированном отчете остаточная стоимость только признаваемая объектом налогообложения. Далеко не факт, что она будет или должна быть равна остаточной стоимости в ведомости.
Тем более сейчас немного другой способ расчета налоговой базы, еще не все мозги переключились.