Скорее всего у тебя вот это:
Для файлового режима работы в настройках системы (обычно Сервис - Настройка параметров учета) должен быть указан пользователь для выполнения регламентных заданий и интервал опроса. Под этим пользователем нужно держать дополнительный запущенный сеанс 1С:Предприятие, который будет выступать в роли планировщика для запуска заданий.