Лично я соглашусь с отсутствием модульности, как следствие - сильная взаимосвязанность, сложность разработки и обновлений.
А с приходом новых технологий: УФ, полноценный клиент-сервер, web-клиент этот эффект только усиливается.
Только не ООП !
Уже сейчас в типовых не разобраться.
В конфах на УФ, с их подсистемами и командами, чтобы найти нужную форму или строку кода - быстрее запустить поиск текста кнопки/предупреждения по всей конфигурации, чем пошагово выйти на нужную процедуру.
С ООП это вообще будет дохлый номер - скорее помрешь, чем разберешься в логике написанного.