Использую типовые правила. В них почему то не реализована выгрузка договоров из БП в УТ.
Дописываю ПКО Договоры в правилах.
в Бухгалтерии Договор подчинен Контрагентам, в торговле не подчинен

Странно сами договора переносятся, но без поля Контрагента, все остальные нужные поля выгружаются успешно.
в ПКО идет соответствие Владелец - Контрагент  правило КОнтрагенты.

В чем может быть проблема ?

наверно в твоём правиле нет контрагентов