Насколько я помню, говорилось, что WhatsApp использует протокол XMPP и его расширения, а протокол этот открытый.
Другое дело, что они не сторонники использования их приложения на устройствах, отличных от телефонов и планшетов, где есть SIM-карты, так как учётка привязывается к номеру телефона.