Этот документ нельзя провести или распровести.
В табличной части, отображаются проводки, но хранятся они в регистре бухгалтерии "Хозрасчетный".

Есть несколько документов помеченных на удалении, табличная часть в документе заполнена, но хранится она не в самом документе.
Написал простой запрос:

ВЫБРАТЬ
    Хозрасчетный.Период,
    Хозрасчетный.Регистратор,
    Хозрасчетный.НомерСтроки,
    Хозрасчетный.СчетКт,
    Хозрасчетный.СчетДт,
    Хозрасчетный.Сумма,
    Хозрасчетный.Организация,
    Хозрасчетный.Регистратор.ПометкаУдаления
ИЗ
    РегистрБухгалтерии.Хозрасчетный КАК Хозрасчетный
ГДЕ
    Хозрасчетный.Регистратор = &Регистратор

Есть движения по этому документу, который помечен на удалении. Так и должно быть? С регистром бухгалтерии имею дело первый раз.

там еще есть такое свойство, как активность

Да, так и должно быть.
Или удаляй движения, или отключай активность