Теперь нельзя не выгрузить ее из конфигуратора.
Случайно нет ни у кого обработки или инфы, как все файлы выгрузить во внешний источник.

ВНЕЗАПНО...

Переходите на правильные (SQL) бэкапы.

Неделю в отпуске был

(1) перешел, но в целом хочется, как то все это хранить отдельно

(3) Отлично. А теперь представь, что случилась *опа (не дай бог, конечно) и нужно восстановить базу из бэкапа. И тут тебе захочется, чтобы все восстановилось вместе и согласовано.

Так что это палка о двух концах, подумайте еще.

(0) 1С-совской выгрузкой лучше выгружать данные и не делать так бекапы. Сама 1С не рекомендует. Ибо кривая это выгрука, теряются данные :)