Я правильно понимаю что нельзя включить разделения данных в рабочей конфигурации. Только в новой?
Т.е. к примеру если люди работали в единной базе, а потом захотелось добавить организацию, но в другой "области", чтобы она жила в этой же базе полностью обособленно, то так делать нельзя и разделитель нужно включать на стадии проектировании, т.е. на стадии первого запуска
(0) какие проблемы?
1. открывай конфигуратор устанавливай общий реквизит Организация - Свойство - Разделение данных = Разделять
2. обновляй конфу БД и вперед на мины.