У крипто про есть КриптоПро CSP Server для подписания на сервере.
Вопрос Докуметооборот может работать в такой связке когда КриптоПро CSP не у клиента стоит, а на сервере? кажому ставить по цене 2 700 руб*200 дорого получается + поддерживать

А где будет ключ хранится?
При большом желании в криптопро можно работать из командной строки,но,передав сертификат,потребуется на сервере получить и ключ,если он один на всех,то все замечательно,а если у каждого свой,то как он попадет на сервер?разве только через рдп и сеанс на сервере,но это ,скорей всего,не ваше решение.

(0) "Для того, чтобы проходила подпись ЭП на сервере "1С:Предприятия 8.2", а также авторизация на сервере Такском, закрытая часть ключа должна быть доступна на сервере "1С:Предприятия 8.2". Для этого существует 2 варианта:

Держать ключи на внешнем носителе и при необходимости вставлять его в сервер.
Скопировать закрытые части ключей в реестр сервера"1С:Предприятия 8.2" (в сеансе под пользователем, от имени которого запускается сервис "Агент сервера 1С:Предприятия 8.2") или держать носитель ключа подписи постоянно присоединенным к серверу.
Пароль к закрытой части ключа нужно обязательно сохранить, установив соответствующий флажок."

http://v8.1c.ru/edi/edi_app/1c-taxcom/faq/