Задача: Сделать базу (си шарп). База должна подтягивать данные в режиме онлайн (например остатки по счетам) или очень часто (раз в 10 мин например) из большого количества (30-150) баз 1с (восьмерки типовые). Естественно не хочеться что либо делать во всех базах 1с и вносить во все типовые правки правки. Базы не обязательно в одной сети.

Кто то что то подобное делал? Есть советы? Идеи как такое организовать?

Ну в принципе то можно ж на прямую с базе 8ки без ...
А если базы допилить, то онлайн через odata сделать

Рядом с каждой базой службу,которая периодически запускает процесс,из которого подключение к базе 1с,выборка данных и отправка на сервер в базу.

(1) Для odata не надо ничего допиливать, оно из коробки на 8.3, достаточно опубликовать.

Вот для старых версий 1С придется через COM работать.

Другой вариант это внешняя обработка причем ее можно автоматически запускать из командной строки /Execute

(0) Все просто, либо rest либо допиливать (можно через расширение)

Кошернее чтобы удаленные базы сами стучали (отдавали данные) в центральную

Так что никакого REST'а и допила в плане внесения изменений в конфигурацию в общем случае не требуется