Бух 3 , баз много как организовать обращение к общим процедурам из этих баз .

Программно

Сложить во внешний отчет , как обратится не знаю ?

не совсем понятно... что имеется ввиду:
-хочешь из текущей сессии в текущей ИБ обратиться к другой базе, в ней общей процедуре, и выполнить код оттуда - где: в той базе, к которой подключились или в своей?
(последнее похоже на.....???)

(2) как вариант, засунуть в справочник внешних
инициализировал - вызвал процу модуля объекта
но это надо отслеживать актуальность версии обработки в каждой базе...

фиг знает что там за процедуры у ТС...
у меня, к примеру, сайт через веб-сервис "ходил" в базу за обсчетом корзины, что бы код применения скидок не дублировать

(3) ну например в каждой базе при проведении должна должна выполнятся процедура которая с час написана в модуле документа каждой базы , хотелось бы её вынести и менять в одном месте.

(5) как вариант: выложи внешнюю обработку в папку, до которой любая база достучится, инициализируй оттуда
получится одно место вызова

(6) + с веб-сервисами боюсь не взлетит, т.к. обрабатывать надо по всей видимости не только примитивные типы данных...

(6) да пока других идей нет , ищу как обратиться .

(6) Тогда лучше через http сервис из одной базы получать.

(8) а чего искать? сделай константу с полным путём и обращайся

По-моему, ТС просто нужно синхронизировать конфигурации в двух базах. С помощью хранилища, например.

Можнл общий код вынести в отдельную базу и грузить его оттуда,а потом делать Выполнить.
но,лучше вовремя обновлять все конфигурации.

делай свою ВК и вызывай на здоровье