Как создать иерархию номенклатуры в екселе при выгрузке из 1с?

формировать как обычный отчет с иерархией, полученный отчет сохранить программно в эксель

можно ли это через обычный отчет не скд сделать?

В табличном документе,начать группу,завершить группу,и потом это можно сохранить и будет вам иерархия,а данные,хоть из другого файла ексель брать.

(2) Можно. Но на скд это 10-15 минут, а полностью программно - дольше.
Са НачатьАвтогруппировкуСтрок в синтакс помошнике