Есть бухгалтерия 3.0 типовая, находится на сервере. Насколько большая разница по времени формирования ОСВ в данной базе между 1 и 2 вариантом

1. Если пользователь зашел в базу с локального ПК (4Гб, проц. не сильно шустрый)
2. Пользователь зашёл в базу с терминального сервера

(0) Вряд ли разница будет сильно большой.
Использование терминалок для работы с 1С на УФ через тонкого клиента особого преимущества не даёт.
Единственный случай, когда терминалки оправданы - если клиентские компы совсем уж дохлые и древние, или есть серьезны проблемы с сетью (нестабильная сеть, например, wifi, или удалённый доступ через интернет).

Да и вообще - что за критерий такой - "время вывода ОСВ"? Пользователи там больше ни чем не занимаются, кроме бесконечного формирования ОСВ?