Трудно сбиться тому - чего нет.
По факту нет никаких остаток отпусков, есть первоначальные данные, списание по кадровым или расчетным документам и расчетный остаток.
В первую очередь - обновление, многие разработчики "дорабатывают" подсистему остатков отпусков - может снесли.
Далее смотрите на учетную политику, может переставили флаг с учета по кадровым на расчетные документы.
Требовать и эффективности, и гибкости от одной и той же программы — все равно, что искать очаровательную и скромную жену... по-видимому, нам следует остановиться на чем-то одном из двух. Фредерик Брукс-младший