Судя по изображениям 1 и 2, у вас пропадает документ из результата запроса. Не уверен что дело в группировках. Думаю нужно смотреть наборы данных (Запросы отчета) и способы их соединения. Набор данных не должен меняться в зависимости от использования группировок.
Здесь можно обсудить любую тему при этом оставаясь на форуме для 1Сников, который нужен для работы. Ymryn