Регистрируется ООО, хотят производить пиво, пока 4 наименования.

1) Отпуска в розницу не будет.
2) Отпуск продукции в кегах.
3) Объем производства небольшой, до 300 т.д. в год

Я смотрю куручу верчу 1С бухгалтерия 3. В ней есть справочники виды алк. продукции, классификаторы. В отчетности есть приложения - декларации.

В то же время. Смотрю есть множество решений по обмену с ЕГАИС. Тот же "АлкоСофтТрейд". Необходимо вносить изменения в конфигурацию.

Чего не может типовая Бухгалтерия 3 при работе с ЕГАИС производственному предприятию, что необходимо докупать\дописывать модули?

по любому специализированое решение нужно. Декларации там не главное.
Главное обмен с ЕГАИС , причем свой специфичный именно для производителя.

(1)можно подробнее? В чем специфика обмена именно для производителя?

Ищи поиском "Работа с УТМ". Для алкоголиков это главное. Если пиво, то помарочного учёта не будет, на это не обращай внимание.

(3)Я понял, как минимум, нет возможности выгрузки отчетов о производстве в ЕГАИС. Бухгалтерия типовая обеспечивает только выгрузку инфо о торговых операциях.