ДОброго времени суток, уважаемые!

РИБ. Бух ред.3.
платформа 8.3.13.1513

Допустим в ПодчиненномУзле (ПУ) зарегистрировано изменение 30тыс.объектов для передачи в ГлавныйУзел (ГУ).

В ПУ из ГУ пришел файл обмена. В ПУ жму "Синхронизировать", сначала идет загрузка данных из файла, затем платформа видит, что пришли изменения конфигурации, но все равно зачем-то делает выгрузку данных (а выгрузку 30тыс.объектов долго ждать).
Могу ли я прервать выгрузку данных(закрываю окно, где отображается процесс выгрузки) , нажать "установить обновление"?
Ведь после установки обновления платформа сама выгрузит эти 30тыс.объектов из ПУ в файл обмена для передачи в ГУ

Да. Прервать можно.