Собственно проблему озвучил в заголовке. Может кто сталкивался с ней кто? Смотрел в код ее без особых успехов. Возможно проблема в том, что выполняется она в фоновом задании и для него какие-то настройки нужны? При записи документов вручную по одному регистрация проходит успешно в том же периоде. Равно как и групповое изменение реквизитов типовое из БСП2.

(0) это специально сделано. Часто перепроводят месяц, а то и целый год, какой смысл каждый раз гонять по обмену мегатонны информации.

(1) проводки БУ часто меняются после такого и в базе-приемнике становятся неактуальные обороты, не знаешь как включить регистрацию?

Нашел это место.

Обработка перепроведения устанавливает доп.свойство "ГрупповоеПерепроведение":

Функция ПровестиПервичныйДокумент(ВыборкаПоДокументам, СостояниеПоОрганизации, ТаблицаСообщений, РегистрыТребующиеОчисткиПоДокументам)

ДокументОбъект.ДополнительныеСвойства.Вставить("ГрупповоеПерепроведение", Истина);

А обработчик регистрации использует его как заглушку выполнения своих операторов:

Процедура СинхронизацияДанныхЧерезУниверсальныйФорматПередЗаписьюДокумента(Источник, Отказ, РежимЗаписи, РежимПроведения) Экспорт
    
Если ПроведениеСервер.ГрупповоеПерепроведение(Источник) Тогда
    Возврат;
КонецЕсли;

Документ не изменяется -он перепроводится. Возможно изменяются движения и/или последовательности - данные, которые не мигрируют по плану обмена. Что "не так"?