Переработчик передал продукцию раньше отчета переработчика.
Теперь в регистре Себестоимость на дату Передачи отрицательные остатки.

Есть решение?

(0) Похоже надо в Отчете переработчика поставить что Услуги "Оформляются отдельно", а акт провести по Регл учета другой датой

Но тогда сядут ли услуги на выпуск большой вопрос

Да, если в отчетном периоде создать документ Поступление от переработчика без Отчета переработчика при закрытии месяца в Расчете себестоимости (Распределение затрат и расчет себестоимости) будет ошибка:
Обнаружены отрицательные остатки по количеству в регистре себестоимости по организации "ХХХ" на конец периода ХХХ:
Раздел учета: "Производственные затраты"; Аналитика номенклатуры: "Номенклатура; Назначение; Переработчик"; Количество: "-ХХХ".
В каком периоду у вас будет Отчет переработчика?

(3) вроде переработчик согласился первичку исправить