Режим файловый. Рег. задание запускает команду ПрекратитьРаботуСистемы(Истина, "DESIGNER /Visible ......"); ну например для архивации или индексации, не важно. Подкиньте идею как програмно после этого запустить платформу, может есть какой механизм 1С про который я не знаю. Пока в голову приходит только батник исполняемый шедуллером Винды по расписанию каждые 5 минут например, который смотрит запущен ли процесс 1cv8 и запускает если не запущен.

Сам и отвечу, более детальное прочтение ИТС дало результат, есть команда запуса платформы после выполнения пакетного запуска конфигуратора

/RunEnterprise

Запустить «1С:Предприятие» после исполнения пакетной команды. После команды может быть указана дополнительная командная строка. При запуске «1С:Предприятия», переданные в ней параметры будут использованы вместо параметров текущей сессии. Дополнительная командная строка обязательно должна быть в кавычках, вложенные в нее кавычки должны быть удвоены.