В процессе обновления информационной базы произошла некритическая ошибка: Невозможно установить монопольную блокировку из-за активной транзакции. Убедитесь что все расширения закрыты в конфигураторе". Расширения закрыты. Закрыт даже сам конфигуратор. Ошибка есть.
Вопрос не получил ответов здесь Проблемы при использование расширения

клиент-серверная 1С? возможно повис сеанс

(1) перезапускал сервер, не помогло(

Вероятно в сиквеле процесс еще висит. На больших транзакциях оно довольно долго может откатываться при сбое.

В любом случае надо заглянуть в мониторинг сиквельных процессов.