Есть РС, заполняется при проведении документа. Есть правила обмена, которые этот РС (не документ) перекидывают в другую базу.
Вопрос: как сделать, чтобы удаленные записи в 1 базе тоже удалялись и во второй?
Т.е. документ в 1 базе распроводят или метят на удаление, соответственно записи в РС удаляются.  А в базе приемнике то при этом ничего не удаляется, а надо

Ну так регистрировать удаление надо бы..

набор записей в источнике всегда регистрировать и перезаполнять полностью в приемнике