Здравствуйте!
Как вести учёт товара если один товар это от одной до 40 коробок(в среднем 2-5)?
Интересуют складское хранение и штрихкодирование

(0) начнем с того, какие проблемы вы видите и что хотите получить?

а что на вашем складе принято за SKU?

Заводите упаковки какие хотите, разной вложенности и объема, в чем проблема?
Но только не может быть так, что сегодня эта коробка состоит из 40 мелких коробок, а завтра из 5.
Соотношения должны быть постоянными. Иначе зачем вообще делить на коробки, пусть будет 1 набор, и на складе будет 1 единица товара, а на ней напишете что и как.

Задачу надо сначала поставить правильно, иначе бардак не автоматизировать.

(1), (2) к примеру, в программе имеется номенклатура "стол рабочий", по факту это две коробки - большая и маленькая
Из проблем - пример выше, соответственно проблемы при выдаче товара и инвентаризации
(3) не коробками молока торгуем)

(4) ...к примеру, в программе имеется номенклатура "стол рабочий", по факту это две коробки - большая и маленькая...

для деталей создавать номенклатуру "Стол деталь 1", "Стол деталь 2". Связь хранить в РегСвед

(5) Эта связь в УТ11 называется Динамический набор, по факту со склада будут приходит распоряжения на стол1 и стол2

(6) то что нужно, спасибо!

Во первых,отделить мух от котлет
На складе у вас всегда места и упаковки,приехало 40 коробок-это 40 мест.
То,что из этого можно что-то собрать,вводите через комплектацию или просто делайте шаблоны документов,чтобы вместо товара сразу подбирались его комплектующие.