Поступил ответ от 1С, что через предустановленные источники выбрать себес с НДС нельзя. А ресурс Себестоимость обращается к ресурсу Себестоимость (упр.), который без НДС.
Решение - написать свой произвольный запрос.
Пичаль-тоска.
Компьютеры — прекрасное средство для решения проблем, которых до их появления не было.