пару недель как -( с баз расположенных на внутреннем сервере не работает, при этом настройки не менялись. С локальной копии базы с компьютера работает. Подскажите пожалуйста, может кто сталкивался ?

(0) предполагаю, что с сервера нет доступа к сайтам сервиса

какие сайты можно проверить ?

(2)
npchk.nalog.ru    81.177.31.8    80, HTTP    Сервис ФНС для проверки контрагентов
api.orgregister.1c.ru    185.12.155.122    443, HTTPS    Сервис 1С:Контрагент.
api.taxregister.1c.ru    185.12.155.122    443, HTTPS    Сервис 1С:Контрагент.
api.orgaddress.1c.ru    185.12.155.79    443, HTTPS    Сервис 1С:Контрагент.
api.registrationservices.1c.ru    185.12.155.115    443, HTTPS    Сервис Узнай ИНН

проверь сертификаты сайтов
если конфа на УФ с режимом совметимости 8.3.7 и выше, то используются виндовые сертификаты,
если на сервере было отключено обновление Windows, то можно обновить или вручную добавить корневой и промежуточные сертификаты Root-R3.crt и gsgccr3dvtlsca2020.crt
если конфа старая, то сертификаты надо добавить в cacert.pem или заменить весь файл на новый в папке bin
подробнее есть тут https://www.online-ufa.ru/content/articles/error-1c-kontragent/

конфа новая, сайты не пингуются и с рабочей станции, но все работает, сертификаты на сервере есть.

(0) Добрый день. а случаем у вас не iis развернут?  
Клиенты на которых не работает случаем не вэб или тонкие??
у меня проблема что через толстый клиент работает файловая база, е если через iis файловая база опубликована, то ни вэб ни тонкий клиент не работает с поиском контрагентов.

(6) Развернул второй сервер с точно такими же настройками, только другая конфигурация железа и работает.

(0) +1