Влияет ли на время объединения с новой конфой от поставщика, через обновление если поставить все неизмененные объекты в режим "Не редактируется"?

(0) Нет

Я подумал, что логичнее было бы не сравнивать объекты при обновлении, которые не изменены. Зачем на это тратится время? Или упустил что-то.

(2) Там это по-другому работает же. Когда ты прописываешь новую версию конфе и используешь типовое обновление ты нигде список изменённых модулей не указываешь. Соответственно, изменённые модули вычисляются при обновлении, а не по каким то метаданным. Определение факта изменения - едва ли самая трудоёмкая задача в процессе

(2) Есть любители делать свои поставки от имени типовой конфы 1С, могут быть сюрпризы.
Плюс экспериментировал: ставил объект на замок, но при сравнении он не заменялся на типовую поставку. В итоге объект на замке, а изменения есть. Думаю, этого можно добиться и с выгрузкой\загрузкой конфы через xml.