Комплексная автоматизация 2.5. При групповом изменении штатной обработкой в Документах Приобретение товаров и услуг поставщика и договора документы перестают проводиться (Ошибка: Не удалось найти объект расчетов для договора ...). Если менять поставщика руками тогда проводится. Возможно кто-нибудь уже сталкивался?

очисть объект расчета. при проведении он подтянет правильный.
ну или сам заполняей его
P.S. он не только в шапке, но и в ТЧ взаиморасчёты

а вообще я обычно включаю версионность меняю руками и провожу, потом сравниваю версии, чтобы понять что еще нужно менять

(0) Правильно, потому что там на контрагента и договор (и партнера, кстати) завязано еще куча информации. И вот такая групповая обработка приводит к большим проблемам. Смотри процедуры ПриИзменении на контрагентах и договорах, и ее задействуй при смене.

В общем ошибка связана только из-за не "соответствия" поставщика контрагенту, если создать нового контрагента(партнера) и заменить на него в документах тогда (Ошибка: Не удалось найти объект расчетов для договора ...) не появляется, как предположение возможно в базе отключался учет по партнерам.