Выделил код и сделал (Текст - Блок - Форматировать) обвиняют, что из-за этого сломался код(исполнение кода). Разве такое может быть?

Не должен.
Покажите код до и после

(0) не может

Ну бывают проблемы в расширениях ИзменениеИКонтроль, где при использовании конструкций #Вставка #КонецВставки лучше не менять ничего. ))

(0)

Python - ? :-)

Дык откатитесь на версию из хранилища, из резервной копии.

P.S.
После конструктора запросов, если в тексте запроса была
глупо построенные замены -- возможно.

Слышал байку, когда "умный Вася" отсортировал дерево метаданных и конфа перестала работать, ибо оказалось, что порядок метаданных был выстроен по фэншую, а фэншуй был нарушен.

Код До и После сравнивал, все было хорошо

(5) Не стесняйтесь, покажите.

(3) Неужели до сих пор? Вроде это уже исправили.

(4) Порядок метаданных по феншую выстраивать это конечно сильно
Как и писать подписки на события, работа которых зависит от порядка вызова

(8) Всегда так делаю. А как потом искать? Мне проще по алфавиту